核酸染料加热会失效吗
不会失效。
常用的核酸染料有:
1、EB(溴化乙锭)是高度灵敏的嵌入性芳香族荧光化合物,为强致癌诱变剂,但价格便宜,用于观察琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶中的核酸。
2、GoldView I型/II型染料是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,也可用于RNA染色。
3、GelRed和GelGreen属于大分子产品,经过埃姆斯 AMS 和相关测试,结果表明,该染料的诱变性远小于溴化乙锭(EB),是两种集高灵敏、低毒性和超稳定于一身的极佳的荧光核酸凝胶染色试剂。
4、SYBR Green 和SYBR Gold于1995 年由 Molecular probes 公司推出,是一种高灵敏的核酸染料,稳定性差。
核酸染料的使用方法
下文摘自索莱宝技术文章
GelRed 是一种高灵敏、低毒性和超安全的荧光核酸凝胶染色试剂。它可替代溴化乙锭(EB),并且远高于EB的灵敏度,同时不需要脱色。由于GelRed和EB有相同的光谱特性,因此用它替代EB时不需要更换成像系统。GelRed既可用于预制凝胶也可用于电泳后染色。通常电泳后染色的灵敏度更高,并能排除染料对DNA迁移的干扰 。使用 GelRed进行电泳后染色,操作简单,不需要脱色和特殊溶液。只要将染料稀释在 0.1M NaCl 中,并将凝胶置于染色液中, 30 分钟后就可以观察。染色液在室温下极为稳定,可以多次反复使用。相比而言,预制凝胶由于不需要额外染色过程,因此染料用量更少,更为简单经济。
GelRed核酸染料的特点:
Gelred其水溶染色剂通过美国环保局安全认定,废弃物可直接倒入下水道,而不会造成任何环境污染。
重要提示:
1、无 毒 性:GelRed独特的油性和大分子量特点使其不能穿透细胞膜进入细胞内,艾姆斯氏试验结果也表明,该染料的诱变性远小于EB。其水溶染色剂通过美国环保局安全认定,废弃物可直接倒入下水道,而不会造成任何环境污染。
2、灵敏度高:适用于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移的影响小于SYBR Green I。
3、稳定性高: 可以使用微波炉加热,可以在室温下保存。
4、信噪比高:样品荧光信号强,背景信号低。
5、操作简单:与 EB 一样,在预制胶和电泳过程中不必担心染料降解;而电泳后染色过程也只需30 分钟且无需脱色或冲洗 ,即可直接用紫外凝胶透射仪观察。
6、适用范围广:适用于预制凝胶(胶染法)和凝胶电泳后染色(泡染法)。
7、与标准凝胶成像系统完美兼容 :使用 312nm 激发的 UV 凝胶成像系统时, GelRed 可以完美的替代 EB。
DNA电泳,用什么核酸荧光染料效果好,毒性低
电泳后,核酸需经染色才能显色出带型,常用以下核酸染色剂:1、溴化乙锭(ethidium bromide,EB)最常用的核酸荧光染料,可嵌入核酸双链的配对碱基之间,在紫外线激发下,发出桔红色荧光.EB-DNA复合物中的EB发出的荧光,比游离的凝胶中的EB发出的荧光强度大10倍,因此无需洗净背景即可清楚观察核酸带型.若EB背景太深,可将凝胶 浸泡于1mmol/LMgSO4中1h或10mmol/L MgCl2中5min,使非结合的EB褪色,这 样可检查到10ng的DNA样品,EB也可用于检测单链DNA或RNA,但其对单链核酸的亲和力相对较小,荧光产率也相对较低.在凝胶或电泳缓冲液中加入终浓度为0.5μg/ml的EB,染色可在电泳过程中进行,能随时观察核酸的迁移情况.但EB带正电荷,嵌入碱基后增加了 核酸分子的刚性,使迁移率减慢,故不宜用于测定核酸分子量的大小,这时应在电泳后将凝胶浸入0.5μg/ml的EB水溶液中10min进行染色.EB见光 易分解,应于4℃避光保存,2、吖啶橙(acridine orange,AO):吖啶橙可嵌入双链核酸碱基对之间,在254nm紫外线激发下发出530nm的绿色荧光;还通过静电与单链核酸的磷酸基结合,在254nm紫外线激发 下产生640nm的红色荧光.因此可区分单链和双链核酸,灵敏度分别为0.1μg和0.05μg.但吖啶橙的染色操作要求严格,应在 22℃,0.01mol/L磷酸钠缓冲液(pH7.0)中避光浸泡30min,然后在搪瓷盘中用该缓冲剂4℃脱色过夜或22℃脱色1~2小时.3、银(Ag+)试剂:Ag+与核酸形成稳定复合物,然后用甲醛使Ag+还原成银颗粒.AgNO3等试剂可使聚丙烯酰胺凝胶上的单链,双链DNA及 RNA都染成黑褐色.银染法的灵敏度比EB染色高200倍左右,比亚甲蓝染色高100~1000倍,在小于0.5mm厚的凝胶中,能检测出0.5ng的 RNA,其缺点是专一性不强,能与蛋白质,去污剂反应也产生褐色,而且对DNA的染色定量不准确.银与DNA稳定结合,对DNA有破坏作用,不适于DNA 片段回收的制备.4、亚甲蓝(methylene blue)可将RNA染成蓝色,但灵敏度不高,而且操作时间长.胶浸泡于0.02%的亚甲蓝,10mmol/L Tris-Ac(pH8.3),4℃放置1~2h,用净水洗5~8h(反复换水),带型肉眼可见,最低检测量为 250ng.